Missing coverage evidence...
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TGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCAGAG  >  minE/2163554‑2163614 |                                                             tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2551228/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:945949/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:890198/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:83538/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:764772/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:47121/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:3603975/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:35958/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:3499637/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:3412543/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:3229934/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:3222556/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:3163935/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:3144072/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:293625/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2580288/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:1041817/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2509474/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2386079/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2381572/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2345186/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2311588/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2244673/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2100714/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:2021750/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:188899/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:1884143/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:1775705/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:1607665/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:1569300/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:139750/61‑1 (MQ=255) tGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCagag  <  1:1231664/61‑1 (MQ=255) |                                                             TGAACTCAATTCCCAAACATCAATGCGGTCAGCACAAAATCCAGCCCCAGAACAGCCAGAG  >  minE/2163554‑2163614

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑