Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2205040	2205048	9	21 [0]	[0] 10	aaeR	predicted DNA‑binding transcriptional regulator, efflux system

TGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGC  >  minE/2205049‑2205109 |                                                             tGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:1566181/1‑61 (MQ=255) tGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:173776/1‑61 (MQ=255) tGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:202058/1‑61 (MQ=255) tGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:280122/1‑61 (MQ=255) tGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:3124742/1‑61 (MQ=255) tGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:3243856/1‑61 (MQ=255) tGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:3280288/1‑61 (MQ=255) tGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:3413165/1‑61 (MQ=255) tGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:3533657/1‑61 (MQ=255) tGTATGCCTACAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGc  >  1:2529139/1‑61 (MQ=255) |                                                             TGTATGCCTTCAATAACACCCCCATCGGGACGCTACGCATTGGCTGTTCTTCAACTATGGC  >  minE/2205049‑2205109

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑