Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2205362	2205419	58	6 [0]	[0] 13	aaeR	predicted DNA‑binding transcriptional regulator, efflux system

GGGATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTA  >  minE/2205420‑2205462 |                                           gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:1307339/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:1648788/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:1898500/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:2211777/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:2554242/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:2717144/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:3013243/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:3116888/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:3169690/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:341537/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:596223/43‑1 (MQ=255) gggATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:999135/43‑1 (MQ=255) gggATCTCCACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTa  <  1:3317485/43‑1 (MQ=255) |                                           GGGATCTCGACTCGCCTGATCCCACAAGGAAGATTTGTGACTA  >  minE/2205420‑2205462

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑