Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2217608	2217621	14	18 [0]	[0] 40	yhdA	conserved inner membrane protein

GGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAG  >  minE/2217622‑2217681 |                                                            ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCtttt                      >  1:3211043/1‑40 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCttt                       >  1:2870681/1‑39 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTg           >  1:1143056/1‑51 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:3395555/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2405806/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2608821/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:271422/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2963092/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:3005294/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:3190109/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:3288475/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2335296/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:348300/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:3575420/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:377766/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:400058/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:420375/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:70074/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:724836/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:803958/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1722513/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1095745/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1371922/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1389857/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1549820/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1554315/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1585576/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1653369/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1686387/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:1081619/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:18269/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2085535/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2124629/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2133507/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2176516/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2224751/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2278467/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2328232/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:2331830/1‑60 (MQ=255) ggCTTTGATTAACCGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAg  >  1:659866/1‑60 (MQ=255) |                                                            GGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAG  >  minE/2217622‑2217681

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑