Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2237772	2237851	80	55 [0]	[0] 34	zraR	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with ZraS

CCACTTCCACCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAT  >  minE/2237852‑2237912 |                                                             ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCTAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:2189068/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:3551010/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:2986019/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:302453/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:3103632/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:3287844/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:3370572/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:337892/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:3399964/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:2946158/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:3577161/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:387164/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:477096/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:488520/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:49566/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:82515/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:858786/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:988628/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:1382745/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:287313/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:2754482/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:2675381/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:248552/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:2433770/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:2214167/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:2055758/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:2041207/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:1967697/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:1928377/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:1849076/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:1639045/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:1633125/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:1518907/61‑1 (MQ=255) ccacttccacCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAt  <  1:1467687/61‑1 (MQ=255) |                                                             CCACTTCCACCAACGGCTGAATATCCTGACTTTGTCCCAGCGGGATCGGCGTACTGGCAAT  >  minE/2237852‑2237912

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑