Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2242790	2242848	59	41 [0]	[0] 67	yjaG	conserved hypothetical protein

CGCTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACG  >  minE/2242849‑2242901 |                                                     cgcTCCAGACGGAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:3596486/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:3110622/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:3498579/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:3483853/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:3459508/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:332484/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:3254055/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:3200045/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:31610/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:3587387/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:3101178/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2981386/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2956282/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2805099/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2804569/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2675312/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:263991/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:263333/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2613699/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:433983/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:463177/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:549812/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:579237/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:626709/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:653905/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:659083/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:714837/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:815265/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:858678/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:926776/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:927573/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:927787/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:95179/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:952723/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1563442/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1868754/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1788942/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1751599/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1707338/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1695905/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1639750/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1613763/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1611658/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1871744/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1468625/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1445656/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1401875/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1338617/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1255212/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1207142/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1143297/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1103344/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1875888/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1932584/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1940193/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:1987131/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:200995/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2034987/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2061301/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2105111/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2109692/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:214676/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2382099/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2445132/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2472441/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2491485/53‑1 (MQ=255) cgcTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACg  <  1:2531390/53‑1 (MQ=255) |                                                     CGCTCCAGACGCAGATGAATTGGGTTTTGTAACATGTTGAGTTCTCAAATACG  >  minE/2242849‑2242901

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑