Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2253247	2253290	44	64 [0]	[0] 40	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

GTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTAA  >  minE/2253291‑2253352 |                                                              gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:3570258/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:3028448/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:3106864/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:316886/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:326965/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:3361222/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:3395422/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:3429430/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:3459154/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:3549632/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:2948345/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:494753/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:559385/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:614558/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:66732/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:752061/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:782351/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:789636/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:816285/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:833249/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:2194500/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:115713/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:1245328/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:1333337/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:1464716/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:159475/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:177681/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:1825105/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:1966990/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:1980285/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:1056663/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:2510043/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:253536/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:2553840/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:2692769/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:2705013/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:275343/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:2829163/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:2839630/62‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTaa  <  1:2862953/62‑1 (MQ=255) |                                                              GTTAATCTTAACGCCCTGCAGACGGTATACGTCCTGTACTTCGTTAACGATGTAACGAGTAA  >  minE/2253291‑2253352

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑