Missing coverage evidence...
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GGAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTC  >  minE/2260760‑2260821 |                                                              ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACTGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:2320340/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:2336479/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:893804/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:3504262/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:3414092/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:3373352/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:3310348/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:3303869/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:3128357/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:3023101/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:2892422/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:2884507/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:2860362/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:2845704/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:282464/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:2644473/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:24482/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1215226/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:2139870/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:2079362/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1941590/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1928197/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1795886/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  >  1:1741374/1‑62 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1712281/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1682598/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:157874/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1547917/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1373769/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1345076/62‑1 (MQ=255) ggAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTc  <  1:1333866/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGAATTTCGCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGTGCCTTCCGGCGCTTC  >  minE/2260760‑2260821

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑