Missing coverage evidence...
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CAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGGTGAAT  >  minE/2302935‑2302996 |                                                              cAGTCGTGCGGCGCACCCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGGTGAAt  >  1:2774601/1‑62 (MQ=255) cAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGCTCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTAc           >  1:773092/1‑53 (MQ=255) cAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAg                      >  1:3093486/1‑42 (MQ=255) cAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGGt      >  1:1150370/1‑58 (MQ=255) cAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGGTGaa   >  1:1011091/1‑61 (MQ=255) cAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGGTGaa   >  1:3113936/1‑61 (MQ=255) cAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGGTGaa   >  1:3185080/1‑61 (MQ=255) cAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGGTGaa   >  1:2343272/1‑61 (MQ=255) cAGTCGTGCGGCGCAACCAGCAGATCGCCAGGTTTCAAAAAGACGGTCGTTACCAGGTGaa   >  1:2189608/1‑61 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑