Missing coverage evidence...
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CTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAGCGC  >  minE/2305672‑2305732 |                                                             cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3129905/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:748415/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:688763/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:530015/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3620375/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3538559/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3478610/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3400391/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3278741/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3278439/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3206382/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3199409/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3172023/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:1054302/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:3101508/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:2992642/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:2533348/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:2409002/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:2177705/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:2085003/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:2043734/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:2019206/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:2005166/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcg   >  1:3624678/1‑60 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGAGCAATTCATAgcgc  >  1:1639013/1‑61 (MQ=255) cTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACAGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAgcgc  >  1:1658024/1‑61 (MQ=255) cTGGAGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTc         >  1:2930657/1‑54 (MQ=255) |                                                             CTGGTGAGCGGTTGCGATTGAATACCGAACAGGCCACCGCCGTTGGCGCAATTCATAGCGC  >  minE/2305672‑2305732

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑