Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	211821	211837	17	11 [0]	[0] 37	mltD	predicted membrane‑bound lytic murein transglycosylase D

TTGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGC  >  minE/211838‑211899 |                                                              ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:3362586/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2677321/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2780757/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:283464/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2986399/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:3120521/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:3134068/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:3203568/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:3317980/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:3350361/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2646408/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:3383001/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:3528536/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:554966/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:562157/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:704339/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:723195/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:763715/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:976083/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:1807174/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:1075475/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:1111262/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:1410120/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:1424996/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:1440170/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:1468007/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:1723007/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:1019764/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2119742/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2143926/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2199671/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:220339/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2449324/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2459944/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2563673/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTTCTTTGGCAACATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:146499/62‑1 (MQ=255) ttGATCTGCATGCTACTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGc  <  1:2514464/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTGATCTGCATGCTTCTTTGGCACCATCACGTACTGCGGGCCACTTGCGCCCAGCGTGGAGC  >  minE/211838‑211899

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑