Missing coverage evidence...
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CGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATC  >  minE/2334632‑2334693 |                                                              cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGtcc         >  1:2505174/1‑53 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTAt   >  1:1701263/1‑61 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:372109/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:2794636/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:2827691/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:2849384/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:3004682/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:3042240/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:3161035/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:3546042/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:983138/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:467602/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:517845/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:528864/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:600586/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:697685/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:97970/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1222231/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1860102/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1462604/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1606244/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1723949/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1765123/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1778528/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1792399/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1851931/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:2550904/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1907752/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:1947976/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:195778/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:2062914/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:2101787/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:2186237/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATc  >  1:2326163/1‑62 (MQ=255) cGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGCTGCGGTTATc  >  1:857894/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGATGGAGAGCAACGGTAAGGCGCTGGCCGATATTACCGATCCGGCAACCGGTGCGGTTATC  >  minE/2334632‑2334693

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑