Missing coverage evidence...
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AGCTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCAA  >  minE/2340133‑2340194 |                                                              agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:453109/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:2752226/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:3039673/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:3220501/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:3385002/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:3401055/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:3432583/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:360606/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:3637829/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:2593345/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:54365/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:572415/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:630961/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:692319/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:853392/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:879478/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:971743/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:980403/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:1828862/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:1227112/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:1243878/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:1449901/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:1553713/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:160213/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:175420/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:1793316/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:1802747/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:1146895/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:2059673/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:2087524/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:2181058/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:2296925/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:2333294/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:236788/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:2396168/62‑1 (MQ=255) agcTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCaa  <  1:2416940/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGCTTGTCTACCAGGGTGGTTTTACCATGGTCTACGTGCGCGATGATGGCGATATTACGCAA  >  minE/2340133‑2340194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑