Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2342523	2342537	15	11 [0]	[0] 42	glnL	sensory kinase in two‑component regulatory system with GlnG

TCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGC  >  minE/2342538‑2342599 |                                                              tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGcc                             >  1:1211142/1‑35 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGTACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:402001/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGAt                 >  1:3637010/1‑47 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATgg   >  1:651075/1‑61 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:45112/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:3321677/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:3325316/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:3347045/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:3580423/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:360217/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:3602583/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:3611280/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:394069/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:3319979/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:466868/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:554158/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:631783/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:659116/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:739889/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:823670/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:87068/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:876583/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1839818/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1115974/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1165068/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1233170/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1321734/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1332953/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1464378/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1478789/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1588750/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:1646782/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:111509/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:2000405/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:2064874/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:2075644/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:2362579/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:2409036/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:2464747/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:2466863/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:311795/1‑62 (MQ=255) tCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGc  >  1:3159701/1‑62 (MQ=255) |                                                              TCGCATATCCTTTCTGTGACGGCCCAGCGTATGCCGGACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGC  >  minE/2342538‑2342599

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑