Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2343488 2343573 86 43 [0] [1] 120 glnG fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

Only 100 of 120 total aligned reads displayed.

TCATTATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGT  >  minE/2343570‑2343629
    |                                                       
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATTCTGCCGTCAgc                     <  1:1746071/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1069461/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1856821/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1895703/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2002965/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2022508/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2179351/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2287508/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2304646/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:367485/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:367284/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:3593102/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2348239/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2399272/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2440645/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2151627/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2483400/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:250313/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2564519/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2611135/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2623112/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:3520159/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2667320/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:3427050/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:3361809/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2847241/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:2898826/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:3054875/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:3118477/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:3187397/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1568409/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:94622/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:942400/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:934400/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1213760/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:893992/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1258736/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1265277/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1274956/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1390756/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1429523/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:758822/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1460368/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1806/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:755173/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:745410/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1657450/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:68843/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:178386/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1777686/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1775377/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:705934/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:728374/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1708387/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1712411/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:1697900/37‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2479263/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:686361/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:3572422/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:3241736/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:3248262/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:3276846/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:906447/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:339187/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:595116/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:461103/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:441041/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:375166/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:3550589/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:805714/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2184983/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1075337/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1137966/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1146879/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1159120/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1214278/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1444854/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1447661/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1578619/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1581450/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:163695/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1752973/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1793453/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:1858880/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2175615/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:3051293/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2186915/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2257013/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2307330/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:233667/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2342158/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:242158/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:257800/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2660080/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2673647/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2798254/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2813744/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2925621/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGt  <  1:2978691/56‑1 (MQ=255)
    tATGACCGCACATTCCGATCCGGATGCTGCCGTCAgc                     <  1:3338174/37‑1 (MQ=255)
    |                                                       
TCATTATGACCGCACATTCCGATCTGGATGCTGCCGTCAGCGCCTATCAACAAGGGGCGT  >  minE/2343570‑2343629

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑