Missing coverage evidence...
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TGATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACACC  >  minE/2352190‑2352251 |                                                              tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGaa          >  1:1621408/1‑54 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCacac   >  1:3640132/1‑61 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCacac   >  1:2525335/1‑61 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:3169734/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:953947/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2537470/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2554936/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2601363/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2674027/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2785592/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2959703/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:3001491/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:3063248/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:860183/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:3274339/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2497908/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:3647633/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:950633/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:412110/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:533994/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:672502/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:849457/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:858045/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1789250/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1024106/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1060266/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1114224/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1115739/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:113264/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1388782/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:149244/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1577666/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1637103/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:170327/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1013807/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:1877290/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2005849/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2084472/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2266882/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2267251/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2319638/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2347927/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2384375/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACAcc  >  1:2459002/1‑62 (MQ=255) tgATTTTATGATGTATTGCTGGTCTGAAGGTCTGGCg                           >  1:2548055/1‑37 (MQ=255) |                                                              TGATTTTATGATGTATTGCTGGTGTGAAGGTCTGGCGGTATTACTGCATCTGAACCCACACC  >  minE/2352190‑2352251

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑