Missing coverage evidence...
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CTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAC  >  minE/2356933‑2356994 |                                                              cTGATTTGGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:115585/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGTCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2400089/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCTTGTGGGTCCATGAc  <  1:1086143/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2653740/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:871365/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2677532/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2747437/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2928742/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2931028/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2967407/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3074340/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3106351/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3148780/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3169207/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3206188/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3311944/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3350468/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3382015/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3487331/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3497098/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:3556284/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:403906/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:413265/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:469373/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:634144/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:101186/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1725843/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1189133/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1275016/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1348001/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1393059/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1530483/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1596208/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1673712/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1698840/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1709223/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1978273/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:200628/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2061086/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2126380/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2157023/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2188060/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2239543/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2256424/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2540871/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCATGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:1335860/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATAAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2472183/62‑1 (MQ=255) cTGATTTAGCAGCCAGCCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAc  <  1:2585104/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTGATTTAGCAGCCAGGCTTAATCATCAGCGCAAAGATGCGCCTGTCGTGTGGGTCCATGAC  >  minE/2356933‑2356994

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑