Missing coverage evidence...
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CATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCA  >  minE/2383608‑2383669 |                                                              cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTTAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2909394/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:3304341/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2277985/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2435937/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2675015/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:26923/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2819701/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2855517/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2988425/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:3180363/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:3225990/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:3275587/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2230417/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:3418388/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:34689/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:4115/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:432511/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:654890/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:659321/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:674943/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:719683/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:791442/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:807718/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1690859/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1130344/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1137255/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1177451/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1242311/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1326055/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1332162/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1440342/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1471192/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1585295/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1627129/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1659048/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1088049/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:176182/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1816371/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1844359/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:1874372/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:195137/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2048841/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2079437/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2131077/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2192280/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2202603/62‑1 (MQ=255) cATGATGTCGTTAAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCa  <  1:2848035/62‑1 (MQ=255) |                                                              CATGATGTCGTTGAACTCGCAATAACACATGTGAGTGTGGATTTGTGTGTCATCTTTCGCCA  >  minE/2383608‑2383669

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑