Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2430991	2431002	12	26 [0]	[0] 46	rho	transcription termination factor

GAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACATTT  >  minE/2431003‑2431061 |                                                           gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTTAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2919666/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:357645/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3039350/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3065757/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3307740/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3333104/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3353482/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3390540/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3404071/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3469743/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3552860/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:3573025/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:904446/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:367181/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:390999/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:480340/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:650280/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:671590/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:719869/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:744839/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:768487/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:797135/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:883548/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:1241807/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2230578/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:1269934/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:1299603/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:1369753/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:1539629/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:179052/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:1856190/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2061688/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2083317/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2123702/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2127124/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2888257/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2272178/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2560339/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2590615/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2631315/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2634642/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2788227/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2791014/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2823025/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:285072/59‑1 (MQ=255) gAATTCCATTGCATCAATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACAttt  <  1:2668577/59‑1 (MQ=255) |                                                           GAATTCCATTGCATCGATTTCGCCCATCGGGTGAATGATTTTGCGCAGGATCCACATTT  >  minE/2431003‑2431061

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑