Missing coverage evidence...
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GAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTC  >  minE/2451968‑2452028 |                                                             gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCTGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:1694864/1‑61 (MQ=25) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:2773010/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:985629/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:941793/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:758937/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:69935/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:678151/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:485843/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:3469550/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:2997026/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:2875126/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:2858416/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:2802395/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:110536/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:2762057/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:2698964/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:2540617/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:234648/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:1573207/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:1554168/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:1338311/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:1297205/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:1217748/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:1179100/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTc  >  1:1110288/1‑61 (MQ=35) gAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTAACGGTTc  >  1:3086413/1‑61 (MQ=25) |                                                             GAAAATCTTCTCTCAATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTC  >  minE/2451968‑2452028

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑