Missing coverage evidence...
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GCTTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGAA  >  minE/2459599‑2459660 |                                                              gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGTAAAGCTGGaa  <  1:1605327/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:1176639/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:885400/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:670237/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:627543/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:545277/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:477081/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:464492/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:43936/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:3498470/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:338812/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:3238290/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:323323/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:3166707/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:3033860/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:2947747/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:2726236/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:2719916/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:2709699/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:2631668/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:2351023/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:1924846/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:17742/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:1491578/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:129280/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:110520/62‑1 (MQ=255) gctTTATCGGAATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGaa  <  1:2982428/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCTTTATCGGCATTATATTAAAGAGCGCCAAAGACTACCCTTCCGCGCTGGCAAAGCTGGAA  >  minE/2459599‑2459660

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑