Missing coverage evidence...
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GGTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGGAAG  >  minE/2472846‑2472906 |                                                             ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATTCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:183578/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:593612/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:3256983/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:3410772/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:3479840/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:3575512/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:366480/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:474750/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:51394/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:553323/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:565241/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:3050660/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:648871/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:666097/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:691102/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:830678/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:869169/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:87076/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:973926/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:2218901/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:1207027/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:1248938/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:1727367/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:17456/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:182942/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:1868746/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:195725/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:2021348/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:3255463/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:2325309/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:2529644/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:254470/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:2567573/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:2574301/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:2781640/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:2935673/1‑61 (MQ=255) ggTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGgaag  >  1:1027800/1‑61 (MQ=255) |                                                             GGTCATATGACCCGCCTGCGTCGCCTCGGTAAAGTCCAGATGCTGGCACAGGCAGCGGAAG  >  minE/2472846‑2472906

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑