Missing coverage evidence...
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GCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGC  >  minE/2475890‑2475951 |                                                              gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTTCGGTGTTTTAcgcc           >  1:864283/1‑53 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:2631394/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:77151/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:675325/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:3399172/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:3384853/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:3114763/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:2909743/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:2833716/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:2826205/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:280156/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:2662506/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1229781/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:2068002/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1976603/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1884146/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1770604/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1761688/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1745326/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1715411/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1643854/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1571708/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1359782/1‑62 (MQ=255) gCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGc  >  1:1240716/1‑62 (MQ=255) |                                                              GCGGTAAGCCGCTGTACTAATAAAACTCCAGGCCGGGTACGGTGTTTTACGCCGCATCCGGC  >  minE/2475890‑2475951

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑