Missing coverage evidence...
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GGCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCAT  >  minE/2489953‑2490014 |                                                              ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAAcgc                          >  1:3628090/1‑38 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTcc      >  1:2822749/1‑58 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:3073890/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2249792/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2258585/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2432653/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2470837/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2575441/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2716492/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2722861/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2772843/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2996551/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2235108/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:3077505/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:3202284/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:340724/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:3460927/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:3535419/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:3619578/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:666469/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:919003/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1711952/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1042642/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1156570/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1162637/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1214635/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1232204/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1315054/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1322577/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1382558/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1645892/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1714316/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:177076/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1772145/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1795039/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1827567/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1841022/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1854283/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1929348/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:2151137/1‑62 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCa   >  1:1016169/1‑61 (MQ=255) ggCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGAGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCat  >  1:1243309/1‑62 (MQ=255) |                                                              GGCTTCAACGTCAGTTATGTGCTGGATGTTCTGAACGCGCTGAAATGCGAAAACGTCCGCAT  >  minE/2489953‑2490014

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑