Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2495402	2495462	61	17 [0]	[0] 91	emrD	multidrug efflux system protein

CAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGC  >  minE/2495463‑2495518 |                                                        cAGCTAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:169336/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3023997/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:339917/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3387508/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3279017/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3244102/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:324348/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3238316/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:320847/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3148855/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3073492/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3053202/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3487844/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2950740/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2915530/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2891558/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2831622/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2827715/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2827399/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:281592/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2779453/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:272677/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2722482/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2644309/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:602828/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:979803/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:943814/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:911195/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:848239/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:834898/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:742215/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:708385/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:67481/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:654877/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:634129/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2640930/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:5547/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:53518/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:528350/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:49310/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:473206/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:468101/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:455455/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:453214/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:411947/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:3586717/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1462759/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1843564/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1778411/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1638836/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1594235/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1572904/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1541216/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1537893/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1533631/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:152757/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1509183/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1490227/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1888787/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:142252/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1297175/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1269445/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1231444/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1196355/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1185511/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1118678/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:10888/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1087327/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1028666/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1900939/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2640290/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2561168/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2555405/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2477699/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2465489/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2438239/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2422241/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2417296/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2354996/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2353437/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2268892/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2195936/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2156431/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:214908/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2080607/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2022123/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1996749/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1991005/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1957743/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:1011435/56‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTCCCACATTAACGTGGAGAAGc  <  1:2715967/56‑1 (MQ=255) |                                                        CAGCAAGCCAGCCAGCAGGCAGCAGATAACCGACTGCCACATTAACGTGGAGAAGC  >  minE/2495463‑2495518

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑