Missing coverage evidence...
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GACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCT  >  minE/2503345‑2503406 |                                                              gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2334492/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:987189/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:982223/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:807809/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:802531/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:682737/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:3517720/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:3388877/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:3203091/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2975077/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2892915/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2833181/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2828302/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2797166/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2534018/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2405395/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1078622/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:232833/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2015632/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:2012486/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1957392/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:195629/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1928221/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1845131/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1825590/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1771252/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1703592/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1607546/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:160114/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1454236/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1379690/62‑1 (MQ=255) gACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCt  <  1:1267427/62‑1 (MQ=255) |                                                              GACGGCAAAAACACCAAACAATTCCTGCCGTTCATGCTGATCCTCTCTGCTATTTGTATGCT  >  minE/2503345‑2503406

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑