Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2539422	2539423	2	43 [0]	[0] 22	rfaI	UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase

GATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAT  >  minE/2539424‑2539485 |                                                              gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTGAt  <  1:2393811/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2229043/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:824967/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:733389/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:617730/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:560716/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:3593616/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:3369948/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2629140/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2623595/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2466091/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:1485914/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2196047/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2083899/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2059868/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2053792/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2049552/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:2024560/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:1992859/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:1704272/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:1598569/62‑1 (MQ=255) gATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAt  <  1:153680/62‑1 (MQ=255) |                                                              GATAAAGCATTAAAACTGGGAAACTATAAAGTAATGATATAAGGGTAGCATTGTGGACTCAT  >  minE/2539424‑2539485

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑