Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2543360	2543380	21	64 [0]	[0] 18	rfaL	O‑antigen ligase

CAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAG  >  minE/2543381‑2543441 |                                                             caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:3031174/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:968590/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:858572/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:64950/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:586620/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:3444614/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:3419435/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:340879/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:3129188/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:1075222/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:2807618/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:2774988/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:2442535/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:2350896/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:2195189/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:1798287/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:1455761/1‑61 (MQ=255) caATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAg  >  1:1117682/1‑61 (MQ=255) |                                                             CAATGCCAAGCGTTAATATCAACAAACCCAAAGCTCGTTTTTTATATGCTATATAAAATAG  >  minE/2543381‑2543441

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑