Missing coverage evidence...
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AGCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCACGGAA  >  minE/2552534‑2552594 |                                                             agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:2448080/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:923276/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:876042/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:857207/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:420289/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:3567028/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:3220470/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:2965663/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:2679438/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:1278989/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:2269778/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:223144/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:1904345/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:1902899/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:1835192/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:1814237/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:1630748/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:1566449/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:1418869/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacggaa  >  1:1393235/1‑61 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacgga   >  1:2588467/1‑60 (MQ=255) agCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCacgga   >  1:283289/1‑60 (MQ=255) |                                                             AGCGATTAGCATAAACAGGTTCTATCGGTTTCTTCGGTTTGCACAGCTTCACGCCACGGAA  >  minE/2552534‑2552594

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑