Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2561779	2561803	25	47 [0]	[0] 12	lldR	DNA‑binding transcriptional repressor

AATGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGA  >  minE/2561804‑2561864 |                                                             aaTGGCGTCTATGACAGCCTGATGTTGTTGGGTCAGTtgtg                      >  1:1881603/1‑41 (MQ=38) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGt           >  1:74499/1‑52 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:1200132/1‑61 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:1533647/1‑61 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:1690240/1‑61 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:1834117/1‑61 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:2140217/1‑61 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:2271129/1‑61 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:2478190/1‑61 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:2556502/1‑61 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:3090366/1‑61 (MQ=255) aaTGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGa  >  1:3222326/1‑61 (MQ=255) |                                                             AATGGCGTCAATGACAGCCTGATGTTGTTCGGTCAGTTGTGAAAAAACCGGTGGCACCAGA  >  minE/2561804‑2561864

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑