Missing coverage evidence...
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GTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGACC  >  minE/2587146‑2587207 |                                                              gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2893756/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2462199/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2529620/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2539468/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2626657/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2663188/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2689014/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:269154/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2706643/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2769335/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2854085/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2292659/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:3141119/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:3145453/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:3229231/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:3283343/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:480480/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:71851/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:808620/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:828785/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:845999/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:856368/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1723442/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1113987/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:111787/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1149472/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1209281/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1425173/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1540907/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1548437/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1591926/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1614468/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1707788/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1780770/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:179040/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1799786/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:185835/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1877004/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1891348/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1906521/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2136184/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:2219809/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1004871/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATAGCCAGacc  <  1:2370760/62‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCAGTAAGTTCATGATCGCCAGacc  <  1:1017422/62‑1 (MQ=255) |                                                              GTAATGGTCGGTGGCGCAATCTGCGGATACTGCGCAACCGGTAAGTTCATGATCGCCAGACC  >  minE/2587146‑2587207

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑