Missing coverage evidence...
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AGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGTT  >  minE/2595165‑2595226 |                                                              aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:3613501/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:2934521/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:2953452/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:2970804/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:2998762/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:3073488/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:3136970/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:3240835/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:3444369/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:2750444/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:368581/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:373602/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:45147/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:609449/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:777205/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:963684/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:999612/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1023151/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:2677915/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:2488377/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:2308622/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:2183340/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1786237/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:173865/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:170702/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1672815/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1570148/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1524188/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1461231/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1288367/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1253646/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1155256/62‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGtt  <  1:1058800/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGTTCATCGCGCGTTGGCGGAGTTTCCAGATAATGGATAATAGTCGGTTCTGTGCCGCTGTT  >  minE/2595165‑2595226

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑