Missing coverage evidence...
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GACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGC  >  minE/2639066‑2639127 |                                                              gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTggcgg          >  1:2479973/1‑54 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAg   >  1:2758808/1‑61 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:1123484/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:468373/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:387260/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:377949/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:3106484/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:308638/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:3044984/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:2977924/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:2974843/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:2958903/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:2919239/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:2907720/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:235682/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:2343563/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:2319421/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:2310422/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:1852273/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:1647180/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:1575987/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:1538553/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:1516231/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:1020846/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCACATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:139417/1‑62 (MQ=255) gACAACGAGTATGAGTAACGGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGc  >  1:2523049/1‑62 (MQ=255) |                                                              GACAACGAGTATGAGTAACTGGCCTTATCCCCGCATCGTCGCTCATCGTGGCGGCGGTAAGC  >  minE/2639066‑2639127

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑