Missing coverage evidence...
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CGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGT  >  minE/2640763‑2640824 |                                                              cGGACAGCAAAGAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:169332/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAg    >  1:2478711/1‑60 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:984000/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1068898/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:548140/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:402871/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:3626908/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:3614356/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:3606100/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:3601668/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:3576946/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:3266078/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:2989767/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:2907283/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:2822760/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:2537928/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:2154986/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1919394/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1765769/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1709349/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1702143/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1607581/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1495019/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1243144/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1239153/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1166194/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1157542/1‑62 (MQ=255) cGGACAGCAAAAAATCACTCACCTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGt  >  1:1273751/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGGACAGCAAAAAATCACTCACTTCGCATCTGGCTTCCGGCACACCGGGTACGGTAGCAGGT  >  minE/2640763‑2640824

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑