Missing coverage evidence...
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ATAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGA  >  minE/2647609‑2647670 |                                                              aTAGGGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:1104141/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTATTTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:3180172/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:798155/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:1096997/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:732403/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:657992/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:596155/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:465242/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:440896/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:43503/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:3558223/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:3546074/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:2977160/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:2554639/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:2469609/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:2275493/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:2137372/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:176694/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:157279/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:1331817/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGa  >  1:1228329/1‑62 (MQ=255) aTAGAGACGTGAATAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTgg    >  1:252254/1‑60 (MQ=255) |                                                              ATAGAGACGTGATTAACGCGCTAATTGCAGGCCATTTTGCGGATCCTTTTTCCGTACTGGGA  >  minE/2647609‑2647670

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑