Missing coverage evidence...
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GGATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAGG  >  minE/2649961‑2650022 |                                                              ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGt                            >  1:2733594/1‑36 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCTAgg  >  1:12349/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:3595293/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:975106/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:27645/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:3199104/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:3303620/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:3318647/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:3441178/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:345223/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:3559735/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1161427/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:3598465/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:520924/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:54557/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:62807/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:628974/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:633386/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:737518/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:851175/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1774889/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1318168/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1360322/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1416581/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1466791/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1606666/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1609474/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:2615118/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1905477/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:2335801/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:240768/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:2440750/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:2519009/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:2532093/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:2560646/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:2588969/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACACGCCGAgg  >  1:1463161/1‑62 (MQ=255) ggATGCGCGACCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAgg  >  1:1503440/1‑62 (MQ=255) |                                                              GGATGCGCGCCCGGGTTTGCGTTATGGTTATCGCGTTCATGGCCCCTGGCAACCCGCCGAGG  >  minE/2649961‑2650022

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑