Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2662033	2662069	37	60 [0]	[0] 6	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

ATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCT  >  minE/2662070‑2662131 |                                                              aTCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCt  <  1:1291412/62‑1 (MQ=255) aTCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCt  <  1:1781682/62‑1 (MQ=255) aTCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCt  <  1:2713106/62‑1 (MQ=255) aTCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCt  <  1:2758004/62‑1 (MQ=255) aTCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCt  <  1:3021983/62‑1 (MQ=255) aTCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCt  <  1:32742/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCT  >  minE/2662070‑2662131

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑