Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2662141	2662191	51	25 [0]	[0] 68	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

GCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACTTTT  >  minE/2662192‑2662226 |                                   gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2443278/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:318349/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:3071182/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:3066300/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2694750/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2651655/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2634517/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2542523/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2484305/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:3297888/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2392329/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2340551/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2273733/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2207445/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2123610/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2111562/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1001576/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:3567246/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:680897/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:657536/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:638730/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:62921/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:496279/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:445122/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:438170/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:422315/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2109980/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:3487481/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:344931/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:34437/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:3416447/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:339011/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:3330361/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:3310316/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1633706/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1021892/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1024528/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1052915/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1066962/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1091731/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1121890/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1123996/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1128262/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:124031/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1258597/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1408853/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1412042/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1496969/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1503068/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:2085753/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1875729/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:207591/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1995291/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:195073/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1936414/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1924800/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1914950/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1899813/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1892504/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1729918/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1837275/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1821214/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1790343/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1788678/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1779588/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:175720/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCGGGATTTAATCGCCACtttt  >  1:3511551/1‑35 (MQ=255) gCAGAATCGGCGCGCAGGATTTGATCGCCACtttt  >  1:1594397/1‑35 (MQ=255) |                                   GCAGAATCGGCGCGCGGGATTTGATCGCCACTTTT  >  minE/2662192‑2662226

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑