Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2662839	2662858	20	46 [0]	[0] 45	rtcR/rtcB	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression/conserved hypothetical protein

ATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAA  >  minE/2662859‑2662905 |                                               aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCTGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1973374/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGTTTACGGACGTaa  <  1:3067794/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:3345506/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2666078/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2730896/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2904487/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2987926/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:3036824/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:3039606/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:3108633/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:315889/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:3327759/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2448856/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:3364116/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:3440298/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:3494662/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:3643339/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:564837/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:655774/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:757993/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:780471/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:969882/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:995713/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:163189/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1112920/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1235885/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:129721/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1320029/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1337659/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1386011/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1410448/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1422059/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1495317/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:150616/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2591018/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1975076/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2019254/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2044184/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2130258/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2180824/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2209990/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2243649/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2258749/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:2386352/47‑1 (MQ=255) aTTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTaa  <  1:1094785/47‑1 (MQ=255) |                                               ATTATCGGTAAATTGGCTTTGCGGGAAATCTCCGGTTACGGACGTAA  >  minE/2662859‑2662905

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑