Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2662906	2662909	4	49 [0]	[0] 24	rtcR/rtcB	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression/conserved hypothetical protein

ATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCACGAC  >  minE/2662910‑2662971 |                                                              ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:2544312/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:9572/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:910337/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:709068/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:554936/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:495583/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:3389191/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:3288236/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:2919030/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:2828067/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:2759904/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:2456601/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:2392582/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:2296789/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:1830887/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:1725780/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:1660530/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:1620983/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:1497176/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:1487801/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:1458970/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:1344102/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCGTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:2814829/62‑1 (MQ=255) ataATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGATGCTTATTTAATTTTCTGGCacgac  <  1:1198294/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATAATCTTTTTTAAAACAATGAATTAAAAAATTAAGCTGCTTATTTAATTTTCTGGCACGAC  >  minE/2662910‑2662971

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑