Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2665261 2665267 7 3 [0] [0] 76 [rtcA] [rtcA]

GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATC  >  minE/2665268‑2665327
|                                                           
gagtTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:973634/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTaa                          >  1:3246241/1‑36 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAATCTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2960/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACt                       >  1:3478422/1‑39 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTa                     >  1:134169/1‑41 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTAccc         >  1:3484262/1‑53 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCcatcat   >  1:2532025/1‑59 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3378201/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:282623/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3377922/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3358876/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3329630/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3273280/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3268863/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:870902/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:323429/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3215304/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3210436/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3208867/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3178844/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:314421/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3055516/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:806119/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3419828/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3432007/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3437444/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3472451/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3484788/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3491044/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:3620547/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:425214/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:470818/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:493077/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:530167/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:605297/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:624442/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:667300/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:741084/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:765857/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1704232/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2056876/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2048487/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2012339/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:198850/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1963169/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1813945/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1768720/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1767503/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1733238/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2192170/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1665046/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1630460/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1560890/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1558853/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1411126/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1328535/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1305681/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:121993/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2537215/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:1014771/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2805152/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2748085/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2747571/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2730683/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2730447/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2669667/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2557929/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2891928/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2463129/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2461233/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2379870/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2331975/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2281487/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2272452/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2242436/1‑60 (MQ=255)
gagaTGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCatcatc  >  1:2203800/1‑60 (MQ=255)
|                                                           
GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATC  >  minE/2665268‑2665327

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: