Missing coverage evidence...
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ATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCG  >  minE/244498‑244559 |                                                              atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:328948/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2511479/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2548329/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2658120/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2764010/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2903297/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2918246/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2918649/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:3040297/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:3144270/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:3165221/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:3172845/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:3278066/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2464110/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:3332297/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:3348264/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:342833/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:57270/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:613435/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:705275/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:726118/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:876973/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:899240/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:936952/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:942333/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1753848/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1107493/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1110199/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:11822/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1244234/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1291397/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1527409/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1642577/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1649292/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1657312/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1676997/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1715389/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1033860/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1760934/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1816400/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1831178/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1868002/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1889628/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1914092/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1930871/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1951563/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:1978422/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2184787/62‑1 (MQ=255) atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCg  <  1:2305696/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCG  >  minE/244498‑244559

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑