Missing coverage evidence...
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CATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACGCTGGGGGATGATTGCTACCGGATTACTTC  >  minE/2688656‑2688717 |                                                              cATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACTCTGGGGGATGATTGCTa              >  1:1021990/1‑50 (MQ=255) cATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACGCTGGGGgat                      >  1:3497843/1‑42 (MQ=255) cATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACGCTGGGGGATGATTGCTACCGGATTACtt   >  1:1269766/1‑61 (MQ=255) cATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACGCTGGGGGATGATTGCTACCGGATTACTTc  >  1:3269088/1‑62 (MQ=255) cATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACGCTGGGGGATGATTGCTACCGGATTACTTc  >  1:2792340/1‑62 (MQ=255) cATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACGCTGGGGGATGATTGCTACCGGATTACTTc  >  1:325882/1‑62 (MQ=255) cATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACGCTGGGGGATGATTGCTACCGGATTACTTc  >  1:3258550/1‑62 (MQ=255) cATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACGCTGGGGGATGATTGCTACCGGATTACTTc  >  1:3144890/1‑62 (MQ=255) cATGGATAACGTTGAACTTTCACCCGCAACACGCTGGGGGATGATTGCTACCGGATTACTTc  >  1:3118503/1‑62 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑