Missing coverage evidence...
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TATCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGG  >  minE/2701239‑2701299 |                                                             tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCTGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1698428/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCttg  <  1:1348350/61‑3 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgt  <  1:2795687/61‑2 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:3446745/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:243540/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:252076/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2796509/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2855052/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2859062/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:3201724/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:3333925/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:3334095/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:3419085/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:3423422/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2376833/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:3460897/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:3508066/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:355418/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:3573269/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:508027/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:601879/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:640526/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:641705/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:648107/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2019852/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1077179/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1078925/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1092076/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1129326/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1225882/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1248728/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1341433/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:153750/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1668608/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1938910/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2434024/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2143230/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:21444/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2150146/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2156341/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2161044/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2170093/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2250926/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:2343058/61‑1 (MQ=255) tatCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTgg  <  1:1009410/61‑1 (MQ=255) |                                                             TATCAGGTTTCCAGCGGGGAAAGTGGCGCGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGG  >  minE/2701239‑2701299

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑