Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	246690	246742	53	8 [0]	[0] 55	phoR	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB

AAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAC  >  minE/246743‑246804 |                                                              aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAg                          >  1:214396/1‑38 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAAc                       >  1:628877/1‑41 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACAt                     >  1:3567225/1‑43 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGtttc  >  1:2372733/1‑60 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGtt    >  1:1709394/1‑60 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTa   >  1:2696627/1‑61 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTa   >  1:3109605/1‑61 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:3597059/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2824335/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2864620/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:3021651/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:3125938/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:3262149/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:3347534/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:3463878/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:3500647/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:3518172/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2603167/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:3605812/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:574717/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:603542/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:624018/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:727921/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:736986/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:744427/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:782259/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:930696/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:953054/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:996512/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1881008/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1177508/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1179387/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1208828/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1312374/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1396395/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1405027/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1407295/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1495769/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1540846/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:168744/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1718646/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2674878/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1956324/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1997106/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2023726/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2149051/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2176149/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2309910/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2319317/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2332020/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2428332/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2466547/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1072098/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:2651565/1‑62 (MQ=255) aaaTTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAAAGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAc  >  1:1541592/1‑62 (MQ=255) |                                                              AAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAGAACATCCTTAACCTACTGCGTTAC  >  minE/246743‑246804

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑