Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2808255	2808338	84	35 [0]	[1] 76	[aphA]	[aphA]

CGCTCTAAACAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCTGGGACTA  >  minE/2808332‑2808393        |                                                       cGCTCTAAACAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCTGGGACTa  >  1:577870/1‑62 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCTCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2393785/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCTTCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1874256/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCg                  >  1:3447925/1‑39 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTACCCCt         >  1:275636/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAAccc          >  1:860925/1‑47 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAAccc          >  1:3066167/1‑47 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAAccc          >  1:623705/1‑47 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3282704/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3518916/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3268123/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3255047/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:32007/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3197598/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3117319/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3044098/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3031095/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3015669/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2994856/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2994853/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2987226/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2915473/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:679923/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:931823/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:879993/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:850409/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:846061/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:838767/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:80322/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:709680/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:68507/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3313896/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:639153/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:6221/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:533726/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:400447/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:3639144/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:279865/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:337332/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1752522/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2860260/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2026901/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:202314/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:197600/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1970690/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1959555/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1926724/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:182493/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2028374/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1709454/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1707367/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1705305/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:131737/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:123132/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1097787/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1096846/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2057082/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:107012/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2670508/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2635407/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2620919/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2573585/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2484262/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2445151/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2371846/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2366708/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2348167/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2297728/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2253711/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2231561/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2148400/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2040554/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCAACGCTTAACCCt         >  1:132082/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCTGTTGCACTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:1553539/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGCAGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:93050/1‑48 (MQ=255)        aaCAGTTCCGATGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCt         >  1:2468356/1‑48 (MQ=255)        |                                                       CGCTCTAAACAGTTCCGCTGTTGCCCTGGCCTCATCTCCTTCACCGCTTAACCCTGGGACTA  >  minE/2808332‑2808393

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑