Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2816208	2816254	47	5 [0]	[0] 10	soxS	DNA‑binding transcriptional dual regulator

CATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCT  >  minE/2816255‑2816316 |                                                              cATAACTATGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:1120762/62‑1 (MQ=255) cATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:1529466/62‑1 (MQ=255) cATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:1876285/62‑1 (MQ=255) cATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:222014/62‑1 (MQ=255) cATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:2705997/62‑1 (MQ=255) cATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:2935895/62‑1 (MQ=255) cATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:519051/62‑1 (MQ=255) cATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:522403/62‑1 (MQ=255) cATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:523578/62‑1 (MQ=255) cATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCt  <  1:929621/62‑1 (MQ=255) |                                                              CATAAATCTGCCTCTTTTCAGTGTTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCT  >  minE/2816255‑2816316

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑