Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	256349	256432	84	29 [0]	[0] 40	secD	SecYEG protein translocase auxillary subunit

CCCGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGACC  >  minE/256433‑256494 |                                                              cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTg                          >  1:1245380/1‑38 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3642432/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3163680/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:318307/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3225601/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3271643/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3309481/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3390196/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3395929/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:354128/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3546908/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3555418/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3158009/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:376977/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:496372/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:544682/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:593534/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:710247/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:740360/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:82020/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:908760/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:226174/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:1136283/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:1243986/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:127652/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:1405179/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:163825/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:1666083/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:1702571/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:2154782/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:2242908/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:1129826/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:2377771/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:2510238/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:2566999/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:265996/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:2820605/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:28323/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:2930720/1‑62 (MQ=255) cccGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGAcc  >  1:3138351/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCCGGCAACGCCGCGCTGGCTGGCAGCTATTCACGCTGAGCCGATGAAGCTCGGCCTTGACC  >  minE/256433‑256494

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑