Missing coverage evidence...
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TTAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTTATA  >  minE/2925148‑2925209 |                                                              ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGCTATCTTGTGGGTtata  <  1:2314167/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:3585539/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:2878687/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:2990592/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:307422/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:3104855/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:3196694/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:3296536/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:3489997/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:2866939/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:379765/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:410847/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:622690/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:776660/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:82498/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:833987/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:879919/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:102582/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:2826315/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:2738216/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:2702961/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:26051/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:2348016/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:1891148/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:1766879/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:1486319/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:147349/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:1470436/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:1328582/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:1193061/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:1164724/62‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTtata  <  1:1146230/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTAAAGTAGCCCTGCTTTTCCCAGTGCTCGTAAAGCGGCTGTTCGATATCTTGTGGGTTATA  >  minE/2925148‑2925209

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑