Missing coverage evidence...
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ACGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTACT  >  minE/2975157‑2975218 |                                                              aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:3257177/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2355426/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:238745/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2449881/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2781494/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2801576/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2912538/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2933902/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:310277/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:3213288/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2248385/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:3339584/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:3532875/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:3617268/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:490461/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:561282/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:764828/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:822880/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:834181/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:87663/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1607098/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1088571/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1187187/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1247717/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1294287/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1304812/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1332792/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1373662/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1401338/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1582828/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1707888/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:180054/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1949727/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:1981904/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2053241/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2134626/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2238500/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTAct  >  1:2244622/1‑62 (MQ=255) aCGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGGTTCTTGTAct  >  1:1056084/1‑62 (MQ=255) |                                                              ACGCTTGTACTTGATACGCTTCGGCTCCAGCGCGTCTGCGCCCAGCGTGCGTTTCTTGTACT  >  minE/2975157‑2975218

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑